Análisis mediante RT-PCR demuestran cuánto tiempo se requiere para superar la infección con Covid-19

El virus SARS-CoV-2 ha sido el responsable del desarrollo de la pandemia de Covid-19. Este virus perteneciente a la familia Coronavirus se caracteriza por poseer ARN como material genético y una envoltura viral compuesta de glicoproteínas. Su secuencia genética está publicada de forma gratuita en la base de datos Genebank desde comienzos de 2020.

La detección de este virus se realiza mediante RT-PCR (reverse transcription- polymerase chain reaction). De forma sencilla, esta técnica permite amplificar una muestra de ADN o ARN, utilizando una enzima polimerasa (ARN polimerasa o ADN polimerasa, según la necesidad). En primera instancia se realiza una copia de la cadena complementaria, y luego se amplifica gracias a la utilización de una enzima de transcripción reversa. Esto permite que la técnica sea muy sensible, aún cuando las muestras poseen baja carga genética. Una vez amplificado se analiza la secuencia de las bases nitrogenadas y a través de bancos de datos se caracteriza de qué organismo de trata la muestra. La técnica RT-PCR en tiempo real se utiliza para no solo amplificar el genoma sino también para cuantificarlo.

Esta técnica es la metodología de oro para diagnosticar casos de Covid-19, y es utilizada en distintas etapas de la infección; no solo para determinar su inicio sino también para determinar cuando el paciente efectivamente está dado de alta.

La dinámica viral de la infección viral ha sido estudiada por investigadores de Wuhan, China, utilizando RT-PCR en tiempo real con un kit de detección para ácidos nucleicos de SARS-CoV-2. En particular testearon dos genes: gen ORF1ab y gen de la proteína de la nucleocápside. Si los resultados para ambos genes resultaban negativos, los investigadores lo consideraban como el tiempo de conversión de ácido nucleico viral; y por tanto el tiempo en el cual el paciente dejaba de estar infectado. Para ello tomaron muestras de 56 pacientes hospitalizados que resultaron positivos para el testeo de este virus, a través de un hisopado nasal y de garganta. La edad media de los pacientes fue de 55 años (60% hombres, 40% mujeres). Ninguno requirió de cuidados intensivos y todos estuvieron recuperados y con el alta hospitalaria al final del seguimiento del análisis.

A cada paciente se le realizaron 5 test, y la duración media de los síntomas fue de 24 días (18-31). En la semana 1, el 100% de los resultados fueron positivos, seguidos por el 89.3% en la semana 2, 66.1% en la semana 3, 32.1% en la semana 4, 5.4% en la semana 5 y finalmente 0% en la semana 6. Los resultados muestran que q partir de la semana 3 en adelante, los resultados negativos comenzaron a aumentar considerablemente. Estos resultados sugieren que la replicación viral de SARS-CoV-2 necesita de un período relativamente largo.

Los resultados fueron divididos en grupos según el tiempo de conversión de ácido nucleico. Observaron que aquellos pacientes que demoraron más en presentar resultados negativos se correspondían con tener mayor edad y más comorbilidades, como diabetes e hipertensión.

Bibliografía:
– Xiao, A. T., Tong, Y. X., & Zhang, S. Profile of RT-PCR for SARS-CoV-2: a preliminary study from 56 COVID-19 patients. Clinical Infectious Diseases. 2020. Doi:
10.1093/cid/ciaa460